El propósito principal de la Comisión es atender las quejas presentadas por la ciudadanía y los colegiados y las colegiadas. Las quejas son evaluadas por las y los integrantes de la Comisión garantizando el debido proceso de ley. Para participar en esta comisión es por invitación. Esto debido a la complejidad, dificultad y confidencialidad de los procesos.